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| 团队名称 | 依托单位 | 首席专家 |
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| 海水池塘生态养殖创新团队 | 黄海所 | 李 健 |
| 海水新养殖鱼类繁育技术创新团队 | 黄海所 | 柳学周 |
| 海水养殖动物营养生理与代谢调控创新团队 | 黄海所 | 梁萌青 |
| 海水陆基工厂化养殖创新团队 | 黄海所 | 曲克明 |
| 近海生态养殖创新团队 | 黄海所 | 蒋增杰 |
| 陆海接力养殖创新团队 | 黄海所 | 关长涛 |
| 盐碱水养殖与渔农综合利用创新团队 | 东海所 | 来琦芳 |
| 养殖鱼类行为解析与应用创新团队 | 东海所 | 张 东 |
| 海水池塘养殖生态环境调控创新团队 | 南海所 | 曹煜成 |
| 深远海养殖技术与品种开发创新团队 | 南海所 | 马振华 |
| 盐碱水域养殖品种开发与利用创新团队 | 黑龙江所 | 徐 伟 |
| 湖库增殖渔业创新团队 | 长江所 | 杨德国 |
| 淡水池塘养殖生态环境调控创新团队 | 珠江所 | 谢 骏 |
| 大宗淡水养殖动物营养与饲料创新团队 | 淡水中心 | 刘 波 |
| 渔农综合种养创新团队 | 淡水中心 | 朱 健 |
| 湖泊生态渔业创新团队 | 淡水中心 | 徐东坡 |
| 长江特色水生动物繁养创新团队 | 淡水中心 | 徐钢春 |
| 渔业水域生态工程创新团队 | 渔机所 | 刘兴国 |
| 海水虾类规模化繁育技术创新团队 | 营口站 | 李 耕 |
| 海水蟹类规模化繁育技术创新团队 | 下营站 | 孙祥山 |
| 海水贝类规模化繁育技术创新团队 | 长岛站 | 蔡忠强 |
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